La balance commerciale du secteur est positive depuis plusieurs années. En 2018, la Flandre a exporté pour 38,4 milliards d'euros de produits agricoles et en a importé 32 milliards soit un excédent de 6,4 milliards (+5%). La viande fraîche est le plus important produit agricole d'exportation avec une valeur d'environ 2,8 milliards, suivie par les produits laitiers (2,8 milliards) et les produits cacaotiers (2,5 milliards). 82% des exportations se font en Europe.

Hors Europe, les principaux marchés sont les USA et la Chine.